Phim "Detective Conan Movie 01: The Timed Skyscraper" bắt đầu với việc Conan Edogawa - nhân vật chính của bộ truyện, người thực chất là Shinichi Kudo bị thu nhỏ thành đứa trẻ - gặp phải một vấn đề khó xử. Cô bạn thân Ran Mouri vừa mời Shinichi (tên thật của Conan) đi xem phim cùng mình. Tuy nhiên, vì hiện tại Conan vẫn còn ở dạng một cậu bé nhỏ tuổi nên anh ta không thể trực tiếp đồng ý hoặc từ chối lời mời này mà không gây nghi ngờ về danh tính bí mật của mình. Điều này tạo ra một tình huống hài hước nhưng cũng đầy thách thức cho Conan khi anh cố gắng tìm cách giải quyết mâu thuẫn giữa mong muốn giữ kín bí mật và mối quan hệ tốt đẹp với những người xung quanh. Trong bối cảnh đó, một vụ án mạng nghiêm trọng xảy ra liên quan đến tòa nhà chọc trời mới được khánh thành, nơi có sự xuất hiện của bom đe dọa sẽ phát nổ vào thời điểm cụ thể nếu như điều kiện đặt ra không được đáp ứng. Với khả năng suy luận sắc sảo và kinh nghiệm điều tra, Conan nhanh chóng nhảy vào cuộc chơi, sử dụng trí thông minh của mình để phá vỡ mọi nút thắt trong vụ án phức tạp này. Qua quá trình điều tra, Conan lần lượt khám phá các manh mối, phân tích chứng cứ và đối chiếu chúng với kiến thức chuyên sâu của mình về tội phạm học. Đồng thời, anh cũng phải cân nhắc làm sao để che giấu hình dáng thực sự của mình trước mắt công chúng, đặc biệt là trước Ran và những người khác có thể nhận ra danh tính thật của anh. Cuộc phiêu lưu đầy hồi hộp và gay cấn này không chỉ giúp Conan gần hơn tới chân tướng của vụ án mà còn khiến anh phải đối diện với những cảm xúc sâu sắc về bản thân và mối quan hệ với những người xung quanh, đặc biệt là Ran. Qua đó, bộ phim mang đến cho khán giả một câu chuyện đầy màu sắc, kết hợp giữa yếu tố trinh thám ly kỳ và cảm xúc con người, khẳng định vị trí của nó trong lòng fan hâm mộ series "Thám tử Conan".