Stargate SG-1 (Phần 3) là hành trình đầy biến động và căng thẳng của đội mình khi họ đối mặt với những mối đe dọa mang tính hệ thống từ Đế chế Goauld. Mùa phim mở đầu với một mối nguy hiểm đặc biệt đáng sợ: Sokar, một Chúa tể Hệ thống cổ và độc ác, được coi như hiện thân của địa ngục. Sokar không chỉ muốn chinh phục, ông ta khao khát biến cả các hành tinh thành địa ngục thực thụ, sử dụng công nghệ Goauld và sự tàn bạo để dập tắt mọi sự chống đối. SG-1 buộc phải đối mặt trực tiếp với sức mạnh kinh hoàng và âm mưu của Sokar, dẫn đến những cuộc đối đầu sinh tử, đặc biệt là trong phần tập phim truyện "The Devil You Know". Tập phim này không chỉ cao trào với hành động giải cứu đầy cam go, mà còn hé lộ sự thật tàn khốc về số phận của Thổ thần và mức độ tàn nhẫn mà Sokar sẵn sàng để đạt được mục tiêu của mình. Tuy nhiên, sự thống trị đáng sợ của Sokar không kéo dài mãi. SG-1, cùng với sự giúp đỡ không thể thiếu của Jacob Carter/Selmak, đã tạo ra một kẽ hở trong kế hoạch của vị Chúa terner Hệ thống này. Tragedy đen tối ập đến, và Sokar đã sụp đổ, chính là kết cục của một Chúa tể Hệ thống quá tự tin và độc ác. Sự ra đi của Sokar, dù là một thắng lợi lớn, lại mở ra một chương mới còn phức tạp và nguy hiểm hơn. Không một ai khác, chính là Apophis, kẻ thù không đội trời chung và là kẻ đã gây ra quá nhiều đau khổ cho Trái Đất và SG-1, đã xuất hiện trở lại. Và không chỉ trở lại, hắn đã tái thiết lại đế chế bị tàn phá của mình một cách ngoạn mục. Tạo dấu ấn đậm nét trong tập phim "The Devil You Know", Apophis đã xuất hiện, không phải trong tư thế kẻ bại trận, mà với tư cách Chúa tể Hệ thống quyền lực nhất, sẵn sàng thách thức tất cả các đối thủ còn lại, kể cả các Chúa tể Hệ thống khác. Việc hắn giành lại quyền lực một cách đầy tham vọng và dữ dội ngay sau cái chết của Sokar đã đặt SG-1 vào vị thế cực kỳ nguy hiểm. Mùa 3 của Stargate SG-1 vì vậy không chỉ là cuộc chiến chống lại ác độc của Sokar, mà còn là cuộc đối đầu cam go với một Apophis mạnh mẽ hơn, quyết đoán hơn và đầy tính toán hơn bao giờ hết, khi sức mạnh của hắn đã trở nên đáng gờm một lần nữa trong giới cai trị của Đế chế Goauld. Áp lực lên đội SG-1 tăng vọt khi họ phải đối mặt với hai thế lực thống trị đáng sợ liên tiếp trong hành trình bảo vệ Trái Đất và các thế hệ con người.