Bộ phim hài lãng mạn Thanh Tra Bí Mật (phiên bản tiếng Hàn mang tên The Auditors) lấy bối cảnh phòng Kiểm toán của tập đoàn JU Construction – cỗ máy khổng lồ ngành xây dựng xứ Hàn, nơi mỗi đồng tiền đi qua đều bị soi xét kỹ càng, nhưng cũng là nơi giấu kín đầy rẫy những mảnh ghép bí ẩn chưa ai tháo gỡ được.
Nhân vật trung tâm đầu tiên là Joo In-ah, trưởng phòng Kiểm toán hiện tại – người đàn bà luôn mặc suit chỉnh tề, cầm ly cà phê đen không đường, lời nói sắc sảo đến mức không nhân viên nào dám hớ hênh trước mặt. Cô có sức hút kỳ lạ: vừa lạnh lùng soi từng đồng sai sót trong báo cáo tài chính, vừa bất ngờ mềm lòng khi thấy nhân viên cấp dưới bị oan. Ít ai biết, cô giữ một bí mật liên quan đến cái chết của cha mình – người từng là kế toán trưởng của tập đoàn, bị vu oan tham ô hàng tỷ won rồi nhảy lầu tự tử 10 năm trước. Từ đó, In-ah quyết tâm leo lên vị trí trưởng phòng kiểm toán, chẳng phải để thăng tiến, mà để tìm bằng chứng xóa oan cho cha, đào xới tận gốc những kẻ đứng sau vụ việc ấy.
Bên cạnh In-ah là Noh Ki-joon, từng là át chủ bài của phòng Kiểm toán, người từng xử lý xong mọi vụ bê bối lớn chỉ trong 3 ngày, được giới truyền thông mệnh danh là "cỗ máy săn tham nhũng". Thế nhưng chỉ sau một đêm, anh bỗng bị giáng chức từ phó phòng xuống nhân viên bình thường, bị giao toàn những nhiệm vụ "tào lao": từ xử lý vụ nhân viên văn phòng trộm đồ vệ sinh, đến làm rõ tin đồn giám đốc chi nhánh ngoại tình với trợ lý. Lý do giáng chức chẳng ai nói rõ, chỉ biết trước đó Ki-joon đã đào được dấu vết quỹ đen chảy vào túi riêng của Phó chủ tịch tập đoàn, và ngay ngày hôm sau, anh bị tước hết quyền hạn, đẩy ra rìa.
Cả hai vốn là đồng đội cũ từng làm việc cùng nhau 5 năm trước, từng có mối tình đồng nghiệp mập mờ nhưng chẳng ai dám thừa nhận. Giờ đây, khi Ki-joon bị hạ nhục, In-ah là người duy nhất không tránh né anh, ngược lại còn giao cho anh những vụ việc nhỏ nhặt nhất, thực chất là để hai người cùng âm thầm điều tra đường dây tham nhũng lớn hơn mà cả hai đều đang nhắm tới. Những phân cảnh làm việc cùng nhau đầy căng thẳng nhưng cũng lầy lội: từ việc giả danh cặp đôi đang yêu để điều tra vụ quan hệ tay ba ở chi nhánh, đến lúc cãi nhau vì một con số sai lệch trong báo cáo rồi bất ngờ va vào nhau ở thang máy, khiến cả phòng kiểm toán phì cười.
Những vụ bê bối mà Ki-joon phải giải quyết ban đầu tưởng chừng vô thưởng vô phạt, nhưng khi đào sâu lại dẫn đến mạng lưới tham nhũng xuyên suốt từ cấp thấp đến cấp cao của tập đoàn. Trong khi đó, bí mật của In-ah dần bại lộ khi Ki-joon tìm thấy tấm ảnh cũ của cha cô trong hồ sơ vụ án năm xưa, khiến hai người từ chỗ đồng nghiệp dè chừng trở thành đồng minh không thể tách rời. Những khoảnh khắc lãng mạn chẳng ồn ào: là Ki-joon mua cho In-ah ly cà phê đen cô hay uống mỗi sáng, là In-ah giúp Ki-joon lấy lại lòng tự trọng sau khi bị giáng chức, tất cả được đan cài khéo léo giữa những phân cảnh truy tìm tham nhũng căng thẳng, tạo nên sức hút riêng cho Thanh Tra Bí Mật so với những bộ phim đề tài văn phòng khác.