Phim Mạch Ngầm Vùng Biên Ải vượt xa motif tình yêu đơn thuần, len lỏi sâu vào muôn vàn góc khuất đời thường, nhất là những mảnh đời gió sương nơi biên cương heo hút. Những câu chuyện ở đây không chỉ dừng ở tình cảm đôi lứa mà còn phơi bày sự khắc nghiệt của thiên nhiên, nỗi day dứt giữa lằn ranh quốc gia, hay những mối dây làng xóm chằng chịt qua bao thế hệ. Nhân vật chính lang thang giữa rừng núi trùng điệp, đối mặt với buôn lậu, mất mát gia đình, và cả những bí mật chôn sâu dưới lớp đất biên ải, khiến khán giả không khỏi day dứt theo từng bước chân họ.