Ở trường trung học Học viện Meisei, một huyền thoại bóng chày đã được kể lại và lại kể lại trong nhiều năm - đó là di sản được tạo ra bởi Tatsuya Uesugi. Trong quá khứ, đội bóng chày của Meisei từng là một thế lực không thể bị đánh bại, với những chiến thắng vang dội và một lịch sử huy hoàng. Nhưng 26 năm đã trôi qua kể từ thời kỳ đỉnh cao đó, và hiện tại, đội bóng chày của trường đã không thể giữ được thành tích đáng kinh ngạc của mình. Theo thời gian, danh tiếng của đội dần dần phai mờ, và những chiến thắng không còn dễ dàng như trước đây. Những cầu thủ mới không thể tái现 lại sự vĩ đại của thế hệ trước, và đội bóng chày của Meisei đã trở thành một phần của lịch sử hơn là một lực lượng hiện tại. Tất cả những điều này đã tạo ra một bầu không khí nặng nề và thất vọng trong trường, nơi mà huyền thoại của Uesugi vẫn còn được nhớ đến nhưng không thể được sánh kịp. Nhưng liệu có ai đó có thể giúp Meisei hồi sinh lại vinh quang cũ? Hay đội bóng chày của trường sẽ mãi mãi gắn liền với quá khứ, không thể tìm lại được sự vĩ đại mà họ từng có? Đó là câu hỏi mà Mix: Meisei Story đặt ra, khi nó kể lại câu chuyện của những cầu thủ mới và sự cố gắng của họ để tái tạo lại di sản của Uesugi và đưa Meisei trở lại vị trí mà nó từng có trong thế giới bóng chày.