Câu chuyện bắt đầu ngay sau phần phim đầu tiên (Death Note) khi Light Yagami gia nhập đội điều tra để truy đuổi kẻ giết người hàng loạt được gọi là "Kira". Trong khi L vẫn hết sức nghi ngờ rằng Light chính là "Kira", Light cố gắng tìm ra tên thật của L để có thể giết anh ta bằng Death Note của mình.